נהוג לחלק את מחלות המעיים הדלקתיות לשתי קטגוריות עיקריות:
מחלת קרוהן (Crohn's disease)
קוליטיס כיבי (Ulcerative colitis)
מחלות מעיים דלקתיות מאופיינות בכיבים ובדלקות חוזרות בחלקים מסוימים של המעיים אשר גורמים לשורה ארוכה של תופעות קליניות.
למחלות אלו קשר הדוק לתופעות אוטו-אימוניות ולחוסר סבילות ואלרגיות למזון, המיוחסות לבררנות לקויה של דופן המעי.
בגלל הפגיעה ברירית המצפה את דפנות המעיים מצליחים חלקיקי מזון בלתי מעוכלים לחדור למחזור הדם ולהפעיל את מערכת החיסון. שתי המחלות מאופיינות בסיכון גבוה לחלות בסרטן מעי הגס.
למחלות אלו יש קשר להפרעות בתפקוד מערכת החיסון ולגורמים פסיכוסומטיים כגון: סטרס, חרדות או דיכאון לאורך זמן.
